Şrek ve Fiona'nın krallığın yönetiminde yaşadığı zorlukları ve bunun getirdiği sorumlulukları ele alıyor. Film, Şrek’in artık bir kral olduğunu öğrenmesiyle başlar. Ancak, Şrek ve Fiona bu yeni yaşam tarzından pek de memnun değillerdir. Huzurlu bataklık hayatlarını özlemektedirler. Bu durumda, tahtın gerçek varisi olan Artus'u bulmak için yola çıkarlar. Eşek ve Çizmeli Kedi de onlara katılır. Artus’u bulduktan sonra, onu ikna etmeleri gerekecektir ki bu süreçte birçok komik ve zorlu macera…